我们再次开展世界一流大学与科研机构学科竞争力评价研究的目的主要是为了在明确世界大学和机构的整体科研水平基础之上清楚认识我国大学目前在世界上所处的位置，促进我国教育和科研的国际化，用国际化的视角来观察我国高等教育发展状况、存在的不足，为逐步地、有重点地培养一批具有国际影响力的大学提供详细而准确的数据参考，从而在此基础上制定进一步改革的制度和措施，促进我国高等教育的健康、快速发展具有重要的意义和现实作用。
第一，贯彻落实有关文件精神，为我国高校管理和促进科技创新与进步提供有力保障。江泽民同志在庆祝北京大学建校一百周年大会的讲话中提出“为了实现现代化，我们要有若干所世界先进水平的一流大学”，并第一次从教育质量的角度全面提出了一流大学办学的目标和评价标准：（1）培养一流的人才；（2）创造一流的科研成果；（3）提供一流的社会服务。
第二，为政府管理部门的科学管理和决策提供定量依据。政府管理部门在建设世界一流大学过程中起着重要的宏观管理和调控作用。尤其是现在为建设世界知名大学而启动的“985工程”已经在全社会引起了巨大的反响。要建成世界一流大学和一流学科，必然要有大量资金的投入和分配，学科资源的整合和调节，这就要求管理部门对我国各科研院所在世界大学和科研机构范围内的相对位置有个大概了解，做到心中有数，从而制定相关资助政策和管理政策。而要做到这些，必然需要详细而准确的定量数据支持，只有这样我们才能够管理和调控我国大学朝科学、健康的方向发展。
第三，为国内各个大学的世界竞争和发展提供定位信息。我国一些大学已经提出了要在一段时间内建成国际知名或著名的高水平大学，但往往还是一个概念的描述，自己到底距世界一流大学还有多远？哪些学科已经达到国际水平？哪些学科还有较大的差距？这些问题并不是每个大学的领导者都很清楚的。我们现在所做的评价就是要使我国的一些高校明确在世界上的相对位置，从而发挥比较优势、找出问题和差距、寻找合作和学习的伙伴单位、明确改革方向、制定相应对策，从而提高国际竞争力和影响力，吸引世界上的杰出人才来我国学习、交流和工作，为将来长远持久的发展提供人才保障。
第四，为青年学子提供详细深入的出国留学咨询报告。在《纲要》中有关人才队伍建设的相关政策中明确提出“加大吸引留学和海外高层次人才工作力度，健全留学人才为国服务的政策措施”，从中可见国家对留学人员的高度重视。国外有着一流的大学和科研机构，他们引领着科技发展的方向，掌握着绝大多数核心技术，在长期实践中又开创着许多著名的学术理论，我们要吸收他们的先进理念和技术，就需要广泛交流。现在不少学子都积极出国深造，但是并不是国外的所有大学都是优秀的，一定要对国外大学及其专业有一个大概了解，绝不能盲目出国。我们提供的报告无疑在一定程度上满足了广大学子准确选择一流大学和专业的迫切需求，为他们出国留学提供了权威可信的咨询报告。
第五，为世界其它国家的大学竞争发展提供数据参考。我们这次的评价包含全世界1565所大学，按照统一的数据来源和统一的统计标准进行。从对比中可以分析出各个大学的优势与劣势、挑战与机遇，这对于任何一所大学的长远发展都是有益的。另外从我们提供的数据中可分析出世界一流大学的国别分布，使每个国家在整体上对自己国家的科研竞争力有所了解，从而在国民经济预算分配上进行适当的调节，并制定切实可行的促进本国科技进步和发展的政策。
